Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJP5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3UJP5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UJP5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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