Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnep1r1Q3UJ81 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnep1r1Q3UJ81 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms