Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Yipf3Q3UDR8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Yipf3Q3UDR8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms