Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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