Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctdnep1Q3TP92 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms