Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp444Q3TDV8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp444Q3TDV8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp444Q3TDV8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms