Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hddc2Q3SXD3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms