Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1rd19Q3KNP5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1rd19Q3KNP5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms