Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4cQ2MDG1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms