Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms