Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cab39Q06138 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms