Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkczQ02956 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkczQ02956 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms