Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp1Q01514 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp1Q01514 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms