Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HmgcrQ01237 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms