Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK6Q00534 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms