Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nkx3-1P97436 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkx3-1P97436 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms