Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nbr1P97432 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms