Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9xP70398 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms