Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf6P70196 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf6P70196 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf6P70196 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf6P70196 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf6P70196 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf6P70196 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf6P70196 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms