Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acta1P68134 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acta1P68134 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acta1P68134 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta1P68134 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms