Protein–RNA interactions for Protein: P68033

Actc1, Actin, alpha cardiac muscle 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actc1P68033 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actc1P68033 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actc1P68033 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actc1P68033 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actc1P68033 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms