Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps28P62858 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps28P62858 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms