Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acta2P62737 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms