Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz1P61924 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms