Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmtd1P59913 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms