Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm2P58774 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms