Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gsc2P56916 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gsc2P56916 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms