Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PltpP55065 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PltpP55065 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PltpP55065 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PltpP55065 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PltpP55065 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PltpP55065 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PltpP55065 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PltpP55065 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PltpP55065 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PltpP55065 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PltpP55065 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PltpP55065 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PltpP55065 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms