Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2E1P51965 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE2E1P51965 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE2E1P51965 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms