Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanccP50652 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanccP50652 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanccP50652 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanccP50652 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanccP50652 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanccP50652 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanccP50652 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanccP50652 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanccP50652 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms