Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TspoP50637 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TspoP50637 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TspoP50637 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TspoP50637 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TspoP50637 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TspoP50637 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TspoP50637 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TspoP50637 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TspoP50637 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TspoP50637 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TspoP50637 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms