Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-1P50220 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms