Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxc13P50207 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms