Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax7P47239 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax7P47239 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms