Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab11bP46638 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab11bP46638 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms