Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox15P43267 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox15P43267 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox15P43267 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox15P43267 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox15P43267 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox15P43267 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox15P43267 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox15P43267 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox15P43267 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sox15P43267 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox15P43267 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox15P43267 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms