Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox7P40646 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox7P40646 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox7P40646 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox7P40646 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox7P40646 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms