Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col18a1P39061 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col18a1P39061 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms