Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3dP35276 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3dP35276 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms