Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc3P33622 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms