Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nedd1P33215 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd1P33215 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms