Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou3f3P31361 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms