Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA6P31267 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA6P31267 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms