Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A5P29400 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A5P29400 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL4A5P29400 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms