Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dusp1P28563 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dusp1P28563 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.7 ms