Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjc1P28229 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjc1P28229 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms