Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lef1P27782 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms