Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms