Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb7P26011 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb7P26011 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms