Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk11bP24788 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk11bP24788 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms